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Revolucionando los estudios del comportamiento animal con tecnología de punta

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Revolucionando los estudios del comportamiento animal con tecnología de punta

Resumen: presentó SMART-BARN, una instalación de última generación para estudiar el comportamiento grupal de los animales.

Ubicada en un granero del siglo XVIII y en un cobertizo de imágenes del tamaño de un gimnasio, la herramienta utiliza técnicas de alto rendimiento, como el seguimiento óptico y acústico, para monitorear animales en 3D. Esto permite a los investigadores estudiar comportamientos e interacciones que antes eran imposibles de capturar en el laboratorio.

SMART-BARN se considera un gran avance en este campo, con aplicaciones que van desde la biología hasta la inteligencia artificial.

Reflejos:

  1. SMART-BARN significa Scalable Multimodal Arena para el seguimiento del comportamiento en tiempo real de un gran número de animales.
  2. La tecnología permite monitorear simultáneamente cientos o incluso miles de animales dependiendo de su tamaño.
  3. El sistema es multidisciplinario, desarrollado por biólogos, físicos, ingenieros e informáticos, y ya ha sido aplicado al estudio de diversas especies, entre ellas palomas, estorninos, polillas, murciélagos y humanos.

Fuente: Universidad de Constanza

Investigadores del Centro de Excelencia para el Estudio Avanzado del Comportamiento Colectivo (CASCB) y el Instituto Max Planck de Comportamiento Animal han transformado un antiguo granero en un laboratorio tecnológico de última generación para análisis de comportamiento complejos. Ahora pueden estudiar allí el complejo comportamiento de grupos de animales.

El granero también sirvió como prototipo para el laboratorio de comportamiento de enjambres más grande de la Universidad de Konstanz: el Imaging Hangar.

Hasta ahora, SMART-BARN se ha utilizado en diferentes casos de uso experimentales con sujetos tan diversos como palomas, estorninos, polillas, murciélagos y humanos. Crédito: Noticias de neurociencia

Una limitación importante de la investigación del comportamiento es que los científicos pueden estudiar animales en ambientes de laboratorio altamente controlados, pero a menudo poco realistas y reducidos, o en condiciones en gran medida incontroladas en la naturaleza.

Esto ha limitado nuestra capacidad para estudiar muchas facetas del comportamiento, incluido el comportamiento colectivo: los movimientos e interacciones entre animales que sustentan sus complejas vidas sociales. ¿Qué se necesita para resolver este problema? Primero, un lugar con mucho espacio. En segundo lugar, la tecnología avanzada.

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Ambos están disponibles en un granero del siglo XVIII en el Instituto Max Planck para el Comportamiento Animal en Möggingen, cerca de Constanza, y ahora en el Imaging Hangar, una sala del tamaño de un gimnasio en la Universidad de Constanza. Ambos laboratorios se utilizan para examinar de cerca el comportamiento grupal de los animales.

Para hacerlo de forma multidimensional, investigadores del Centro de Excelencia para el Estudio Avanzado del Comportamiento Colectivo de la Universidad de Konstanz y el Instituto Max Planck de Comportamiento Animal han desarrollado una herramienta llamada SMART-BARN.

SMART-BARN es un acrónimo de Arena multimodal escalable para el seguimiento en tiempo real del comportamiento animal en grandes cantidades.

«Es una nueva herramienta que permite estudiar los complejos rasgos de comportamiento de un individuo o las interacciones entre grupos de animales como insectos, aves o mamíferos», explica Hemal Naik. En colaboración con Máté Nagy, copresidente del clúster, Iain Couzin, y sus colegas desarrollaron SMART-BARN.

El equipo era muy interdisciplinario: biólogos, físicos, ingenieros e informáticos lo desarrollaron juntos.

Máté Nagy explica con más detalle la herramienta: «Utilizamos técnicas de medición de alto rendimiento, como el seguimiento óptico y acústico, con las que podemos estudiar la posición y postura exactas en 3D de los animales y calcular su campo de visión».

Los usuarios de la nueva instalación tendrán la flexibilidad de realizar diferentes paradigmas experimentales aprovechando la naturaleza modular del sistema.

Por qué es importante la escala

«SMART-BARN está diseñado para mejorar la escala de experiencias de comportamiento típicas en interiores en términos de volumen experimental y rasgos de comportamiento medidos y tamaños de grupo»,

El informático Hemal Naik dice y añade: “Esto significa que los usuarios pueden medir un repertorio de comportamientos nunca antes vistos porque los animales tienen más espacio. La instalación puede, dependiendo del tamaño de los animales, albergar cientos de animales simultáneamente y ampliar la posibilidad de experimentación con nuevas especies que normalmente no se estudian en ambientes interiores.

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«De hecho, ahora hemos extendido este método a miles de animales», añade Couzin. «Recientemente llevamos a cabo un estudio en Imaging Hangar donde rastreamos 10.000 langostas plaga. Esto hubiera sido imposible sin nuestra tecnología SMART-BARN.

Cómo se puede utilizar SMART-BARN

Hasta ahora, SMART-BARN se ha utilizado en diferentes casos de uso experimentales con sujetos tan diversos como palomas, estorninos, polillas, murciélagos y humanos.

Naik está entusiasmado porque: “La instalación está dando forma a nuevas e importantes colaboraciones interdisciplinarias. »

Y continúa: “Por ejemplo, SMART-BARN ofrece la posibilidad de rastrear la mirada y la postura de las aves en un grupo de diez o más en 3D preservando al mismo tiempo su identidad. Los investigadores utilizan esta técnica para explorar el papel de la mirada en la toma de decisiones.

Los científicos informáticos están utilizando la misma técnica para diseñar nuevos algoritmos basados ​​en visión por computadora e inteligencia artificial que faciliten el seguimiento 3D de animales sin colocarles marcadores.

«Nuestro método ha permitido crear un sistema aún mayor en el hangar de imágenes de la Universidad de Constanza, que permite rastrear enjambres de robots o miles de insectos», explica Iain Couzin.

Máté Nagy dice: “En pocas palabras, el alcance de sus aplicaciones sólo está limitado por nuestra capacidad de generar ideas para la experimentación. »

El equipo visualiza la instalación como un espacio colaborativo donde investigadores de todo el mundo pueden contribuir a la exploración de cuestiones de comportamiento. Por ello, el equipo invita a investigadores de todo el mundo a conectarse con ellos y planificar experimentos.

Acerca de esta noticia de investigación en neurociencia del comportamiento

Autor: Helena Dietz
Fuente: Universidad de Constanza
Contactar: Helena Dietz – Universidad de Constanza
Imagen: La imagen está acreditada a Neuroscience News.

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Investigacion original: Acceso libre.
«SMART-BARN: escenario multimodal escalable para el seguimiento en tiempo real del comportamiento de un gran número de animalespor Máté Nagy et al. Los científicos progresan


Abstracto

SMART-BARN: escenario multimodal escalable para el seguimiento en tiempo real del comportamiento de un gran número de animales

El SMART-BARN (arena multimodal escalable para el seguimiento en tiempo real del comportamiento de un gran número de animales) permite una adquisición rápida y robusta de los movimientos, el comportamiento, la comunicación y las interacciones de los animales en grupos, en un gran espacio (14,7 metros por 6,6 metros por 3,8). metros), entorno tridimensional utilizando varios canales de información.

El comportamiento se mide simultáneamente en una amplia gama de taxones (insectos, aves, mamíferos, etc.) y tamaños corporales (desde polillas hasta humanos).

Este sistema incorpora múltiples técnicas de medición simultáneas, que incluyen captura de movimiento con precisión submilimétrica y alta velocidad (300 hercios), grabación y localización acústica, reconocimiento automatizado del comportamiento (visión por computadora) y unidades interactivas controladas remotamente por computadora (por ejemplo, automatizadas). comederos y dispositivos transportados por animales).

Los flujos de datos están disponibles en tiempo real, lo que permite experimentos de circuito cerrado altamente controlados y dependientes del comportamiento, al tiempo que se producen conjuntos de datos completos para análisis fuera de línea.

Las diversas capacidades de SMART-BARN se demuestran a través de tres desafiantes estudios de casos de aves, al tiempo que se destaca su amplia aplicabilidad al análisis a escala fina del comportamiento colectivo de animales de todas las especies.

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Cómo observar las llamaradas de tormentas solares

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Cómo observar las llamaradas de tormentas solares

Es posible que Nueva York pierda la oportunidad de ver la aurora boreal (no gracias a un pronóstico nublado), pero la tormenta solar inusualmente grande que golpea la Tierra podría producir otro espectáculo visual para los neoyorquinos.

¡Es hora de desempolvar esos eclipses! Mientras el sol brilla en este día de primavera relativamente despejado, las llamaradas de manchas solares pueden ser visibles cuando el sol arroja plasma hacia nosotros.

El Observatorio de Dinámica Solar de la NASA capturó estas imágenes de las erupciones solares, como lo muestran los destellos brillantes en la imagen de la izquierda (erupción del 8 de mayo) y en la imagen de la derecha (erupción del 7 de mayo). La imagen muestra un subconjunto de luz ultravioleta extrema que resalta la e

“Algunos fenómenos solares se manifiestan con espectaculares espectáculos de luces, mientras que otros son menos visibles, lo que recompensa a los observadores cuidadosos que están en el lugar correcto en el momento correcto”, según NASA.

De hecho, las manchas solares o “pecas” pueden ser visibles en días despejados. Si son lo suficientemente grandes, parecen pequeños puntos en la cara del sol.

Recuerda: ¡nunca mires directamente al sol sin protección!

Una mujer observa el eclipse solar total con gafas para eclipses solares en Times Square en Nueva York, Estados Unidos, 21 de agosto de 2017. (Foto de Volkan Furuncu/Agencia Anadolu/Getty Images)

¿Qué es una tormenta solar? ¿Por qué esto se considera “extremo”?

aurora boreal sobre Alaska

La aurora boreal vista sobre Frederick Sound en Alaska. (Wolfgang Kaehler/LightRocket vía Getty Images)

Una tormenta solar inusualmente fuerte que azotó la Tierra produjo impresionantes exhibiciones de color en el cielo del hemisferio norte la madrugada del sábado, sin informes inmediatos de interrupciones en el suministro eléctrico y en las comunicaciones.

La Administración Nacional Oceánica y Atmosférica de Estados Unidos emitió una rara advertencia de tormenta geomagnética severa cuando una explosión solar llegó a la Tierra el viernes por la tarde, horas antes de lo esperado. Se esperaba que los efectos de la aurora boreal, que eran claramente visibles en Gran Bretaña, duraran todo el fin de semana y posiblemente hasta la próxima semana.

La aurora boreal (Aurora Boreal) ilumina el cielo sobre la Bahía Norte de San Francisco, vista desde China Camp Beach en San Rafael, California, Estados Unidos, 11 de mayo de 2024. (Foto de Tayfun Coskun/Anadolu vía Getty Images)

Hubo avistamientos «en todo el país», dijo Chris Snell, meteorólogo de la Met Office, la agencia meteorológica británica. Añadió que la oficina estaba recibiendo fotografías e información de otros lugares europeos, incluidos Praga y Barcelona.

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La NOAA alertó a los operadores de plantas de energía y naves espaciales en órbita, así como a la Agencia Federal para el Manejo de Emergencias, para que tomaran precauciones.

Una ilustración del campo magnético de la Tierra que protege nuestro planeta de las partículas solares (NASA/GSFC/SVS/NASA)

Las llamaradas parecen estar asociadas con una mancha solar que tiene 16 veces el diámetro de la Tierra, dijo la NOAA. Todo es parte de la actividad solar que se intensifica a medida que el sol se acerca al pico de su ciclo de 11 años.

– Marcia Dunn, editora aeroespacial de Associated Press

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Cómo se renovó la Luna

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Cómo se renovó la Luna

Puede parecer que nuestra Luna brilla pacíficamente en el cielo nocturno, pero hace miles de millones de años, la agitación volcánica le dio un rostro.

Una pregunta que ha permanecido sin respuesta durante décadas es por qué hay más rocas volcánicas ricas en titanio, como la ilmenita, en el lado cercano que en el otro. Ahora, un equipo de investigadores del Laboratorio Planetario y Lunar de Arizona ofrece una posible explicación para esto.

La superficie lunar estuvo una vez inundada por un océano de magma en ebullición, y después de que el océano de magma se endureció, hubo un gran impacto en el lado opuesto. El calor de este impacto se extendió hacia el lado más cercano e hizo que la corteza se volviera inestable, provocando que capas de minerales más pesados ​​y densos en la superficie se hundieran gradualmente en el manto. Estos volvieron a derretirse y fueron expulsados ​​por los volcanes. La lava de estas erupciones (la mayoría de las cuales ocurrieron en el lado más cercano) terminó en lo que ahora son flujos de rocas volcánicas ricas en titanio. En otras palabras, la antigua cara de la Luna ha desaparecido y resurgido.

lo que hay debajo

La región de la Luna en cuestión se conoce como Procellarum KREEP Terrane (PKT). KREEP significa concentraciones elevadas de potasio (K), elementos de tierras raras (REE) y fósforo (P). Aquí también se encuentran basaltos ricos en ilmenita. Se cree que KREEP y los basaltos se formaron por primera vez cuando la Luna se enfrió después de su fase oceánica magmática. Pero la región siguió siendo caliente porque KREEP también contiene altos niveles de uranio y torio radiactivos.

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«La región PKT… representa la región volcánicamente más activa de la Luna, un resultado natural de la gran abundancia de elementos productores de calor», dijeron los investigadores en un comunicado. estudiar publicado recientemente en Nature Geoscience.

¿Por qué esta región está ubicada en el lado cercano, mientras que el lado opuesto carece de KREEP y basaltos ricos en ilmenita? Una hipótesis existente llamó la atención de los investigadores: sugería que después de que el océano de magma se endureciera en el lado cercano, las capas de estos minerales KREEP eran demasiado pesadas para permanecer en la superficie. Comenzaron a adentrarse más profundamente en el manto y hasta el límite entre el manto y el núcleo. Al hundirse, se pensaba que estas láminas minerales habían dejado rastros de material por todo el manto.

Si la hipótesis fuera correcta, esto significaría que debajo de la superficie lunar deberían existir trazas de minerales de la corteza magmática endurecida de KREEP en forma de láminas, que podrían llegar hasta el borde de la capa límite del núcleo.

¿Cómo se podría probar esto? Los datos gravitacionales de la misión del Laboratorio Interior y de Recuperación de Gravedad (GRAIL) a la Luna pueden haber tenido la respuesta. Esto les permitiría detectar anomalías gravitacionales causadas por la mayor densidad de la roca KREEP en comparación con los materiales circundantes.

Volviendo a la superficie

Los datos de GRAIL revelaron previamente la existencia de un patrón de anomalías de gravedad subsuperficial en la región PKT. Esto parecía similar al patrón que se habrían formado las capas de roca volcánica cuando se hundieron, por lo que el equipo de investigación decidió ejecutar una simulación por computadora del hundimiento de KREEP para ver qué tan bien coincidía la hipótesis con los hallazgos de GRAIL.

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Efectivamente, la simulación terminó formando aproximadamente el mismo patrón que las anomalías encontradas por GRAIL. El patrón poligonal observado tanto en las simulaciones como en los datos de GRAIL probablemente significa que rastros de capas de KREEP más pesadas y basalto rico en ilmenita quedaron debajo de la superficie cuando estas capas se hundieron debido a su densidad, y GRAIL detectó sus residuos debido a su mayor gravedad. . para tirar. GRAIL también sugirió que había muchas anomalías más pequeñas en la región PKT, lo cual tiene sentido dado que gran parte de la corteza está formada por rocas volcánicas que habrían fluido y dejado residuos antes de derretirse y reconstruir la superficie durante las erupciones.

Ahora también tenemos una idea de cuándo ocurrió este fenómeno. Debido a que hay cuencas de impacto que datan de hace aproximadamente 4,22 mil millones de años (que no deben confundirse con el impacto anterior en el lado opuesto), pero se cree que el océano se endureció magmáticamente antes de esa fecha, los investigadores creen que la corteza también comenzó a fluir antes de esa fecha. este tiempo.

«Las anomalías en los límites del PKT proporcionan la evidencia física más directa de la naturaleza del océano post-magma… el derrocamiento del manto y el hundimiento de la ilmenita en el interior profundo», dijo el equipo en el mismo comunicado. estudiar.

Esto es sólo más información sobre cómo evolucionó la Luna y por qué es tan desigual. El lado cercano alguna vez estuvo lleno de lava que ahora es roca volcánica, gran parte de la cual existe en flujos llamados mare (que se traduce como «mar» en latín). La mayor parte de esta roca volcánica, especialmente en la región PKT, contiene elementos de tierras raras.

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Sólo podemos confirmar que en realidad hay rastros de una corteza antigua dentro de la Luna al recolectar material lunar real muy por debajo de la superficie. Cuando los astronautas de Artemis finalmente podrán recolectar muestras de material volcánico en la Luna en el sitio¿Quién sabe qué saldrá a la superficie?

Geociencias naturales, 2024. DOI: 10.1038/s41561-024-01408-2

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La nueva plataforma de edición del epigenoma permite una programación precisa de modificaciones epigenéticas

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La nueva plataforma de edición del epigenoma permite una programación precisa de modificaciones epigenéticas

Los investigadores han desarrollado una nueva plataforma de edición del epigenoma que permite la manipulación precisa de las marcas de cromatina, revelando su impacto directo en la expresión genética y desafiando la comprensión previa de los mecanismos reguladores de los genes.

Un estudio del grupo Hackett del EMBL de Roma ha llevado al desarrollo de una potente tecnología de edición epigenética, que abre la posibilidad de programar con precisión modificaciones de la cromatina.

Comprender cómo se regulan los genes a nivel molecular es un desafío central en la biología moderna. Este complejo mecanismo está impulsado principalmente por la interacción entre proteínas llamadas factores de transcripción, ADN regiones reguladoras y modificaciones epigenéticas: alteraciones químicas que cambian la estructura de la cromatina. El conjunto de modificaciones epigenéticas del genoma de una célula se denomina epigenoma.

Avances en la edición del epigenoma.

En un estudio publicado hoy (9 de mayo) en genética natural, científicos del grupo Hackett del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) en Roma han desarrollado una plataforma modular de edición del epigenoma, un sistema para programar modificaciones epigenéticas en cualquier parte del genoma. El sistema permite a los científicos estudiar el impacto de cada modificación de la cromatina en la transcripción, el mecanismo por el cual los genes se copian en ARNm para impulsar la síntesis de proteínas.

Se cree que las modificaciones de la cromatina contribuyen a la regulación de procesos biológicos clave como el desarrollo, la respuesta a señales ambientales y las enfermedades.

Kit de herramientas de edición epigenética

Representación creativa de la caja de herramientas de edición epigenética: cada edificio representa el estado epigenético de un solo gen (las ventanas oscuras son genes silenciosos, las ventanas iluminadas son genes activos). Crane ilustra el sistema de edición epigenética que permite la deposición de novo de marcas de cromatina en cualquier ubicación genómica. Marzia Munafò

Para comprender los efectos de las marcas de cromatina específicas en la regulación genética, estudios previos han mapeado su distribución en los genomas de tipos de células sanas y enfermas. Al combinar estos datos con el análisis de la expresión genética y los efectos conocidos de la alteración de genes específicos, los científicos han asignado funciones a estas marcas de cromatina.

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Sin embargo, ha resultado difícil determinar la relación causal entre las marcas de cromatina y la regulación genética. El desafío es analizar las contribuciones individuales de los muchos factores complejos involucrados en dicha regulación: marcas de cromatina, factores de transcripción y secuencias reguladoras de ADN.

Avance en la tecnología de edición del epigenoma

Los científicos del grupo Hackett han desarrollado un sistema modular de edición del epigenoma para programar con precisión nueve marcas de cromatina biológicamente importantes en cualquier región deseada del genoma. El sistema se basa en CRISPR, una tecnología de edición del genoma ampliamente utilizada que permite a los investigadores realizar cambios en ubicaciones específicas del ADN con alta precisión y precisión.

Estas alteraciones precisas les permitieron analizar cuidadosamente las relaciones causa-consecuencia entre las marcas de cromatina y sus efectos biológicos. Los científicos también diseñaron y utilizaron un «sistema informador», que les permitió medir los cambios en la expresión genética a nivel unicelular y comprender cómo los cambios en la secuencia del ADN influyen en el impacto de cada marca de cromatina. Sus resultados revelan el papel causal de una serie de importantes marcas de cromatina en la regulación genética.

Hallazgos clave y direcciones futuras

Por ejemplo, los investigadores descubrieron una nueva función para H3K4me3, una marca de cromatina que antes se pensaba que era el resultado de la transcripción. Observaron que H3K4me3 en realidad puede aumentar la transcripción por sí solo si se agrega artificialmente a ubicaciones específicas del ADN.

«Este es un resultado extremadamente emocionante e inesperado que va en contra de todas nuestras expectativas», dijo Cristina Policarpi, becaria postdoctoral en el grupo Hackett y científica principal del estudio. “Nuestros datos apuntan a una red reguladora compleja, en la que varios factores determinantes interactúan para modular los niveles de expresión génica en una célula determinada. Estos factores incluyen la estructura de la cromatina preexistente, la secuencia de ADN subyacente y la ubicación en el genoma.

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Aplicaciones potenciales e investigaciones futuras.

Hackett y sus colegas están explorando actualmente formas de aprovechar esta tecnología a través de una startup prometedora. El siguiente paso será confirmar y ampliar estos hallazgos apuntando a genes en diferentes tipos de células y a gran escala. También queda por aclarar cómo las marcas de cromatina influyen en la transcripción a través de la diversidad genética y los mecanismos posteriores.

«Nuestra caja de herramientas modular de edición epigenética constituye un nuevo enfoque experimental para analizar las interrelaciones entre el genoma y el epigenoma», dijo Jamie Hackett, líder del grupo en EMBL Roma. “El sistema podría utilizarse en el futuro para comprender con mayor precisión la importancia de los cambios epigenómicos a la hora de influir en la actividad genética durante el desarrollo y en las enfermedades humanas. Por otro lado, la tecnología también abre la posibilidad de programar los niveles de expresión genética deseados de una manera altamente personalizable. Esta es una vía interesante para aplicaciones de precisión en la salud y podría resultar útil en el contexto de la enfermedad.

Referencia: “La edición sistemática del epigenoma captura la función instructiva dependiente del contexto de las modificaciones de la cromatina” 9 de mayo de 2024, genética natural.
DOI: 10.1038/s41588-024-01706-w

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